בשנת 1948 עם הקמת המדינה, נושא הכליאה הוכפף לטובת משטרת ישראל. מפכ"ל המשטרה דאז, כונה "המפקח הכללי על המשטרה ובתי הסוהר"
בשנת 1948, התקיים דיון על כפיפות בתי הסוהר למשטרת ישראל. בגלל שביטול ההפרדה נגד את הפקודה הבריטית שהגיעה ב-1946, הוחלט למנות אדם שיכהן גם כמנהל כללי במשרד המשטרה וגם כממונה על בתי הסוהר כולם. כידוע, החלטה זו עוררה סערה שכן רבים טענו שצעד זה נוגד את הפקודה המקומית ולכן שר המשטרה (בכור שטרית) החליט שהחל מה-1 לינואר לשנת 1949, יהפכו המשטרה ושב"ס להיות שני גופים ניפרדים.
